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css3 の box-shadow を使っていたりして、影の重なり方を、後のブロックが下に、前のブロックが上になるようにしたい。html の記述と逆の順番で重なるように、JavaScript で z-index を指定。（position: relative;も同時に指定)

$($('.box').get().reverse()).each(function(i){
  $(this).css({'z-index':i+1, 'position':'relative'});
});